福建省第二人民医院消化内科设立于1993年，现为福建省中医脾胃病重点专科，专科下设的脾胃病实验室为国家二级中医药科研等级实验室，还有卫生部中药新药临床药理研究基地脾胃病研究室。学科带头人杨春波主任医师为国家级名老中医、福建省中医药学会副会长、全国中医脾胃病专业委员会委员、中国中西医结合消化系统疾病专业委员会常务委员、福建省中医脾胃分会及中西医结合消化系统疾病专业委员会主任委员。消化内科现有专家10人，平均年龄39岁，其中主任医师3人，副主任医师4人，硕士生导师3人，1名已获得博士学位，3名获硕士学位。

    消化内科现设有消化病门诊、病区、消化内镜室、呼气实验室、胃肠动力研究室、消化B超室等功能科室。慢性萎缩性胃炎的中医药治疗居国内领先水平；开展有幽门螺杆菌(HP)相关疾病诊治，用无创方法诊断HP感染；肝纤维化早期诊断与治疗及胃肠动力障碍性疾病综合诊治；消化系疾病介入治疗，经内镜、B超等影象学技术，介导中药、理化及生物因子治疗消化系肿瘤、息肉及肝胆结石。

    消化内科的特色门诊   慢性胃炎门诊、慢性肝病门诊、胃肠疾病及Hp相关疾病门诊、胃肠动力门诊、胆胰疾病门诊、消化道肿瘤门诊。研制专科特色制剂胃炎Ⅰ号、Ⅱ号、灵兰胶囊及口服液、清化饮、清化灭幽胶囊、仙叶合剂等。 

    学科研究方向  中医脾胃湿热证的流行病学、临床、基础及药物治疗研究；中医药治疗胃癌前病变的临床及基础研究；胃肠功能性疾病的中医临床证治研究；幽门螺杆菌的中药治疗及机理研究；中医药治疗肝纤维化临床及基础研究。现已承担省厅科研课题十余项， 

    消化病区护理组1999年荣获省直机关“青年文明号”，消化内科2003年荣获福建中医学院“先进带教科室”。