对于微卫星不稳定性（MSI）的评估目前尚未包括在胃癌患者的常规评估当中，因为对其预后价值还没有一致的资料。意大利维罗纳大学的Beghelli S博士及其同事在510名散发性胃癌患者中利用单核苷酸标记物BAT25和BAT26对MSI的临床意义进行了研究，并将结果与错配修复蛋白Mlh1和Msh2的免疫组织化学表达结果进行了比较。结果显示，83例（16%）癌症中存在MSI，且与预后较好相关（P<0.001）。多变量分析显示，MSI表型是一项独立因素（P=0.005），并为TNM分期、位置和年龄增添了预后信息。MSI癌症患者的死亡相对危险度为0.6（95%可信区间[CI]：0.4-0.8）。此外，当根据分期进行分组时，单纯II期癌症中MSI状态对存活具有显著影响（P=0.011；危险比=0.3；95% CI：0.1-0.8）。MSI还与年龄较大（P=0.002）、女性（P<0.001）、肠组织型（P=0.011）、低T分期（P=0.018）和淋巴结累及较少（P<0.001）相关。最后，错配修复蛋白Mlh1和Msh2的免疫组织化学表达结果与微卫星分析的比较显示95%的肿瘤中结果都一致，其敏感性为82%、特异性为98%。Beghelli博士等总结认为，胃癌的微卫星分析可在临床上用于预后的确定，但是在常规临床环境中应当用于单纯II期癌症。尽管微卫星分析更为适宜，但是免疫组织化学方法可能就足够了。